为更好地适应自治区社会稳定、建设丝绸之路经济带核心区和全面开创南疆工作新局面对各级各类，特别是中医药卫生人才的需要，进一步促进中医学院全面、协调、可持续发展，早日实现“升格本科专业”目标。中医学院“以中医学为主干学科，民族医学、养生保健多学科协调发展，强化中医药相关学科的特色和优势”作为学科定位立足点；层次定位中“精简大专专业，本科教育为主，打造研究生教育”；充分实现“创建特色鲜明、提升社会影响力”的目标定位；努力“成为区域经济发展和卫生事业进步的高素质应用型人才培养基地，卫生健康事业和科研创新社会服务基地，中医药高等教育交流与合作的重要平台”作为服务定位。争取全方位，纵深化推进中医学院的发展。

根据中央《关于进一步促进维护新疆社会稳定和实现长治久安的意见》、《中国教育现代化2035》、《健康中国2030规划纲要》、国务院《关于加快推进县级中医医院高质量发展的意见》、《自治区促进中医药传承创新发展的实施意见》、《新疆维吾尔自治区关于扶持和促进中医民族医药事业发展的意见》、《新疆维吾尔自治区中长期教育改革和发展规划纲要—高等教育发展规划》、《中西部高等教育振兴计划》等文件精神，以人才培养为根本，以学科建设为龙头，以改革创新为动力，提高质量促发展、强化特色创优势、推进转型上水平，快速提高教育教学综合实力和社会影响力，把中医学院建成特色鲜明教学研究、高素质应用型专门人才培养基地。